一些研究已經研究了大腸桿菌的蛋白質組。4237個開放閱讀框架中的1627個(38%)已經通過實驗確定。給出了大腸桿菌K-12的4639221個堿基對序列。在注釋的4288個蛋白質編碼基因中，38%沒有被賦予任何功能。與其他五種已測序的微生物進行比較，發現其基因家族普遍存在，且分布較窄。大腸桿菌內部有許多相似基因的家族也很明顯。至大的旁系同源蛋白質家族包含80個ABC轉運蛋白。基因組作為一個整體，就局部復制方向而言是驚人地有組織的。鳥嘌呤、寡核苷酸可能與復制和重組有關，而且大多數基因都是定向的。基因組還包含插入序列(IS)元件、噬菌體殘余物和許多其他異常組成的斑塊，表明基因組通過水平轉移具有可塑性。菌株的應用可以促進人類社會的創新和發展。淺紫灰鏈霉菌菌種

SHBCCD73737人參布哈加瓦氏菌SHBCCD73737=DSM19038Bhargavaeaginsengi模式菌株SHBCCD73738北京布哈加瓦氏菌SHBCCD73738Bhargavaeabeijingensis模式菌株SHBCCD73739中山小短桿菌SHBCCD73739=DSM18832=LMG23926Brachybacteriumzhongshanense模式菌株SHBCCD73740南極類生孢八疊球菌SHBCCD73740=JCM14646Paenisporosarcinaantarctica模式菌株SHBCCD73741格氏李斯特氏菌SHBCCD73741=ATCC35967=CIP100100Listeriagrayi模式菌株SHBCCD73742銅綠假單胞菌SHBCCD73742Pseudomonasaeruginosa2-酮基-L-古龍酸SHBCCD73743矢野氏鞘氨醇單胞菌SHBCCD73743SphingomonasyanoikuyaeSHBCCD73744蒙氏腸球菌SHBCCD73744EnterococcusmundtiiSHBCCD73745嗜熱鏈球菌SHBCCD73745Streptococcusthermophilus乳制品SHBCCD73746植物乳球菌SHBCCD73746=ATCC43199Lactococcusplantarum模式菌株SHBCCD73747環狀芽孢桿菌SHBCCD73747=ATCC4513=JCM2504=LMG13261=NCTC2610Bacilluscirculans模式菌株SHBCCD73748葉際類芽孢桿菌SHBCCD73748PaenibacillusphyllosphaeraeSHBCCD73749無丙二酸檸檬酸桿菌SHBCCD73749CitrobacteramalonaticusSHBCCD73750無丙二酸檸檬酸桿菌SHBCCD73750CitrobacteramalonaticusDokdonella ginsengisoli菌種菌株在醫藥領域中具有普遍的應用，可制備疫苗等。

    SHBCCD24853EubacteriumhalliiEubacteriumhallii腸道益生菌SHBCCD24854RoseburiafaecisRoseburiafaecis腸道益生菌SHBCCD24855RoseburiahominisRoseburiahominis腸道益生菌SHBCCD24856EubacteriumramulusEubacteriumramulus腸道益生菌SHBCCD24857ClostridiumhathewayiClostridiumhathewayi腸道益生菌SHBCCD24858白曲霉Aspergillusalbus制作酒曲SHBCCD24859米曲霉Aspergillusoryzae制作酒曲SHBCCD24860黑曲霉Aspergillusniger制作酒曲SHBCCD24861米曲霉Aspergillusoryzae用于釀造醬油、米酒等。SHBCCD24862米曲霉Aspergillusoryzae用于釀造醬油、米酒等。SHBCCD24863黑曲霉Aspergillusniger用于釀造醬油SHBCCD24864深紅酵母Rhodotorularubra用于釀造醬油SHBCCD24865魯氏酵母Saccharomycesrouxii醬油、食醋、酒發酵后期生香SHBCCD24866蒙奇球擬酵母Torulopsismogii醬油、食醋、酒發酵后期生香SHBCCD24867植質乳桿菌Lactobacillusplantarum醬油、食醋、酒發酵后期生香SHBCCD24868黑曲霉Aspergillusniger酒精,白酒生產糖化菌。

SHBCCD73661巴氏醋桿菌SHBCCD73661AcetobacterpasteurianusSHBCCD73662植物乳桿菌SHBCCD73662=ATCC8014=BCRC10357=CCUG11253=CCUG9289=CGMCC1.1856=CIPA159=DSM20205=JCM1057=JCM665LactobacillusplantarumAssayofbiotinandnicotinicacid,aminoacidSHBCCD73663干酪乳桿菌SHBCCD73663LactobacilluscaseiSHBCCD73664鼠李糖乳桿菌SHBCCD73664LactobacillusrhamnosusSHBCCD73665巴氏醋桿菌SHBCCD73665AcetobacterpasteurianusSHBCCD73666巴氏醋桿菌SHBCCD73666AcetobacterpasteurianusSHBCCD73667巴氏醋桿菌SHBCCD73667AcetobacterpasteurianusSHBCCD73668小腸腸球菌SHBCCD73668=ATCC8043=ATCC9790=BCRC11054=BCRC12496=BCRC80016=CCM2423=CCUG1332=CCUG18659=CCUG19Enterococcushirae模式菌株SHBCCD73669植物乳桿菌SHBCCD73669Lactobacillusplantarum生產表飛鳴SHBCCD73670乳酸乳球菌乳亞種SHBCCD73670L腸膜明串珠菌葡聚糖亞種SHBCCD73671L檸檬色明串珠菌SHBCCD73672LeuconostoccitreumSHBCCD73673布氏乳桿菌SHBCCD73673Lactobacillusbuchneri金黃色葡萄球是常見的化膿性球菌，是醫院交叉傳染的重要來源。

金黃色葡萄球菌（Staphylococcusaureus）簡稱為金葡菌，是較常見的革蘭氏陽性球菌，也是引起細菌性食源性疾病的重要病原菌之一。在顯微鏡下看，金葡菌聚集成簇，像葡萄一樣；在良好的營養環境中，它們會生長成金黃色的菌落，金葡菌由此而得名。金葡菌在哪？金葡菌普遍分布于自然界，人和動物是它們的優良居所。健康人的咽喉、鼻腔、皮膚上常有它的蹤跡，傷口化膿傳染處和上呼吸道傳染者的鼻腔更是它的主要聚集地。上呼吸道傳染者的鼻腔帶菌率超過80%。常見的污染食品為蛋白質或淀粉含量豐富的食品，如：奶和奶制品、肉和肉制品、糕點、剩飯等。銅綠假單胞菌的標本采集，包括來自醫院環境中的各種標本如水、空氣、物體表面采樣等。褐色多形桿菌菌株

金黃色葡萄球在肉湯培養基中24小時后呈均勻混濁生長，在瓊脂平板上形成圓形凸起。淺紫灰鏈霉菌菌種

由于枯草芽孢桿菌有很強的生物同化作用，可應用于清理畜禽養殖場的糞便惡臭，其代謝產物對蚊蠅的生長繁殖也有抑制作用。采用圈舍噴灑、加入發酵床墊料等途徑，可以有效地改善飼養環境。枯草芽孢桿菌對植物病菌的作用機制是多樣的，概括起來主要有競爭作用、拮抗作用、溶菌作用、誘導植物抗病性和促進植物生長等。競爭作用主要包括營養競爭和位點競爭。營養和空間位點的競爭是指存在于同一微小生物環境中的兩個或兩個以上微生物之間爭奪這一環境內的空間、營養、氧氣等的現象。拮抗作用主要指2種或2種以上的微生物共同生長時，一種微生物在同化作用中產生某種或某幾種特異的次生代謝產物，改變其微環境，從而抑制甚至殺死另一種微生物的現象。淺紫灰鏈霉菌菌種

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