選擇質量合格，過期不能用。[1]菌肥必須保存在低溫（適溫度4～10℃）、陰涼、通風、避光處，以免失效。有的菌種需要特定的溫度范圍，如哈茨木霉菌需要保存在2-8℃的恒溫箱內，有效期為一年，而一些芽孢桿菌要根據生產質量高低，主要是看芽孢化水平，芽孢化高的能保存一年半甚至更久，芽孢化不好的達不到半年就失效，所以菜農應謹慎選擇菌肥產品。二、根據菌種特性，選擇使用方法。建議大家在使用生物菌肥的時候，基施可用方法有：撒施、溝施、穴施，也可以撒施一部分，剩余部分可以穴施效果更佳。不建議沖施生物菌肥，這樣效果不佳，但是可以灌根，主要針對液體生物菌肥。三、盡量減少微生物死亡。施用過程中應避免陽光直射；蘸根時加水要適量，使根系完全吸附。蘸根后要及時定植、覆土，且不可與農藥、化肥混合施用，特別是現在很多菜農為防治根莖部病害，使用農藥灌根，如多菌靈、惡霉靈、硫酸銅等藥劑，***、細菌都能防治，但對菌肥中的有益菌也有殺滅作用，所以建議使用菌肥后不要再用農藥灌根。菌劑與根圍分泌物、其他土著微生物的作用結果，達到了改良根圍微生態的效果。山西經濟型生物菌肥咨詢報價
適量施用。土壤中施入較多的菌肥，雖然不會出現燒根燒苗現象，但也并不是施得越多就越好。盲目大量施用生物菌肥，雖然不會向化學肥料那樣造成蔬菜燒根死苗，只是蔬菜植株體內鹽類積累增加，有害消費者的圣體健康，惡化土壤質地，但**起碼增加了肥料投入成本（因為生物菌肥價格較高），降低蔬菜的栽培效益。因此，應根據不同作物的需要和土壤養分狀況，科學地確定生物菌肥施肥量，才能達到增產增收的目的。在土壤狀況比較正常的情況下，一般以畝（667平方米）施用生物菌肥80公斤左右為宜。如果土壤鹽漬化程度較高，可適當增加生物菌肥的施用量。一般根據土壤的鹽漬化程度高低，每畝（667平方米）可適當增施10～20公斤為宜。安徽功能性生物菌肥制造商誤區：靠見效速度評價產品好壞，認為見效快的就是好菌劑或菌肥。
生物菌肥根據其作用不同，又可分為5類：有固氮作用的菌肥：包括根瘤菌、固氮菌、固氮藍藻等；分解土壤有機物的菌肥：包括有機磷細菌和復合細菌等；分解土壤中難溶性礦物的菌肥：包括硅酸鹽細菌、無機磷細菌等；促進作物對土壤養分利用的菌肥：包括菌根菌等；抗病及刺激作物生長的菌肥：包括抗生菌、增產菌等。豐富的有機質還可以改良土壤物理性狀，改善土壤團粒結構，從而使土壤疏松，減少土壤板結，有利于保水、保肥、通氣和促進根系發育，為農作物提供適合的微生態生長環境。
曾經就有個陜西咸陽的果友來咨詢我們說，他家的生物菌用下去20天了，但是卻沒有任何作用，為什么呢？仔細一問才知道，他把生物菌埋進土里頭之后，就沒有再理會了，在太陽曬得土都能冒的情況下依然沒有澆水。這種情況下，生物菌肯定是不能活的了，更不要說繁殖了。這位果友又問，那為什么生物菌在同樣沒有水和營養了的包裝袋里能活呢？這完全是兩碼事。就像我們前面提到的，生物菌在包裝袋里是處于休眠狀態的，不需要水分和養分。所以大家一定要注意這些生物菌的正確使用。很多情況下，不是它不管用，而是我們沒有用好而已。生物菌肥中的菌種具有一定的抗逆性，能夠提高作物的抗病蟲害能力，減少農藥的使用，降低農產品的殘留物。
誤區4：一個季節使用一次就可以，一次使用作用可持續多年部分微生物菌種施入土壤后會大量繁殖，當數量達到一定程度后成為優勢菌群，但外部環境的改變會導致有益菌死亡，從而影響有益菌群在土壤微生物系統中的地位，要繼續保持其地位，就需要在作物的生長期多次使用微生物肥料來補充有益菌。誤區5：不注重菌的種類，認為一種菌可以解決多種問題少數用戶缺乏對癥用菌的意識，選購產品時只注重是否含菌，而不關注菌的種類，使用不對癥的菌品種后，達不到所需目的。現階段在農業部獲得登記的微生物品種有9種，具有不同的功能，要結合需求、菌種特點、菌種功能選用對癥的產品。誤區6：超過保質期使用就沒有效果國家標準規定，“農用微生物菌劑產品”及“有機物料腐熟劑產品”液體制品保質期為3個月，粉劑及顆粒制品為6個月。超過保質期并不意味著產品沒有效果，要區別對待。土壤功能退化及污染加劇，作物生長不良、病害加重、品質下降及產量降低甚至絕收等問題日益嚴重。遼寧經濟型生物菌肥廠家直銷
強降雨也會讓菌肥效果降低。大多數微生物菌肥中的菌都是有氧細菌，需要有氧呼吸。山西經濟型生物菌肥咨詢報價
施用溫度：要合理施用菌肥的比較好溫度是22℃－35℃，低于5℃，高于40℃，施用效果較差。對高溫、低溫、干旱條件下的農作物田塊不宜施用。在對溫室大棚里的土壤或蔬菜育苗用營養土消毒后，至少要經過10-15天，才可以施用生物菌肥，切記不可施用生物菌肥后再實行土壤消毒。不應同時使用菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑。一般先施菌肥，隔48小時后，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。施用地塊：生物菌肥的使用效果和土壤的情況有關。土壤太旱或太濕都不利于生物菌肥效力的發揮，適宜的土壤濕度為60%左右。要適宜對含硫高的土壤和銹水田，不宜施用生物菌肥，因為硫元素能殺死生物菌。對于翻漿的水田，一般不用撒施，用噴霧的方法效果會好些。對于生物有機肥，采用穴施或溝施的方式進行，不建議沖施。復合微生物肥則多采用葉面噴施、沖施等方式進行。生物菌肥如果在水田使用，比較好于清晨或傍晚采用噴施的方法山西經濟型生物菌肥咨詢報價
