生物菌肥主要作用：提高土壤肥力：有些菌劑可以增加土壤中氮磷鉀營養元素的含量；還可以提高一些土壤酶類活性，有利于土壤中養分的轉化方便植物的吸收利用。促進難溶的礦質營養釋放：生物菌肥使土壤酶活性提高，使不溶性土壤養分溶解利于植物吸收。同時，還分泌一些有機酸性物質，能分解有機質，產生的糖有利于固氮細菌的生長。幫助農作物吸收養分：如根瘤菌可刺激豆科植物的根部形成根瘤，使土壤中的氮轉化為作物能吸收的氮肥。增強植物抗病(蟲)能力：生物菌肥中的微生物在土壤中能分泌***、殺蟲劑及植物生長***。***及殺蟲劑能殺滅植物病害及害蟲的蟲卵，植物生長***促進葉綠素含量升高，提高植物光合作用的能力。增強植物的抗逆能力：有些生物菌肥施用后，在土壤中大量生長繁殖，聚集在作物根部形成優勢菌群，在其自身生長過程的同時，改善周圍的環境，提高植物體的抗逆性。提高作物品質：菌群中的側孢芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、凝結芽孢桿菌等可降低植物體內硝酸鹽含量20%以上，能降低重金屬含量，可使果實中Vc含量提高30%以上，可溶性糖提高2~4度。增強植物的抗病能力。生物菌肥中的有益菌群能分泌植物促生物質和***，增強植物抗病能力。天津大豐收生物菌肥技術指導
生物肥對于果樹主要有5大作用：一、改變根量，由細菌產生的IAA、GA、CTK使植物次生根增殖，增加有效根量。二、軟化細胞壁，細菌產生的半聚糖醛酸轉化酶（PATA）可軟化根系細胞壁，從而促進營養吸收。三、產生轉鐵產物，細菌產生的轉鐵產物可聚合或螯合土壤鐵，使之成為對果樹更有效的物質。四、增加磷的有效性，細菌分泌出增加石灰性土壤中磷有效性的酸性物和螯合物。五、阻止病害，細菌改變根際環境，從而***根系病原體的競爭力。天津濕地生物菌肥技術指導菌劑是農用微生物菌劑的簡稱，對應的標準是《農用微生物菌劑》。
沒有根據田間實際狀況對含硫高的土壤和銹水田，不宜施用生物菌肥，因為硫能殺死生物菌。沒有根據土壤墑情施用菌肥的比較好溫度是25℃～27℃，低于5℃、高于45℃，施用效果較差。同時還應掌握固氮菌適宜的土壤濕度為60%左右，即見干見濕的土壤濕度**為適宜。和其他農藥混用，降低活性為防止活菌致死注意千萬不要與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫化肥，如硫酸鉀等以及稻草灰混合用，因為這些藥、肥很容易殺死生物菌。在施用時，若施菌肥與防病蟲、除草相矛盾時，可先施菌肥，隔48小時后再打藥除草；若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。同時還應防止與未腐熟的農家肥混用，因為農家肥在腐熟的過程中會發酵，這樣會直接殺死生物菌。
施用溫度：要合理施用菌肥的比較好溫度是22℃－35℃，低于5℃，高于40℃，施用效果較差。對高溫、低溫、干旱條件下的農作物田塊不宜施用。在對溫室大棚里的土壤或蔬菜育苗用營養土消毒后，至少要經過10-15天，才可以施用生物菌肥，切記不可施用生物菌肥后再實行土壤消毒。不應同時使用菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑。一般先施菌肥，隔48小時后，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。施用地塊：生物菌肥的使用效果和土壤的情況有關。土壤太旱或太濕都不利于生物菌肥效力的發揮，適宜的土壤濕度為60%左右。要適宜對含硫高的土壤和銹水田，不宜施用生物菌肥，因為硫元素能殺死生物菌。對于翻漿的水田，一般不用撒施，用噴霧的方法效果會好些。對于生物有機肥，采用穴施或溝施的方式進行，不建議沖施。復合微生物肥則多采用葉面噴施、沖施等方式進行。生物菌肥如果在水田使用，比較好于清晨或傍晚采用噴施的方法與化學肥料、有機肥料一樣，是農業生產中施用的肥料產品的一部分。
化肥中不含有機質、腐殖質，因此大量使用化肥，土壤由于有機質和腐殖質的缺乏，土壤團粒結構遭到破壞，造成土壤板結，農植物產量下降。化肥利用率低，氮肥因為易揮發、流失，利用率只有30%-50%，磷肥的利用率才10%-25%，因為磷酸根化學活性活潑，施入土壤后大部分磷與土壤中的Zn2+、Mg2+、Ca2+、Fe3+、Al3+等陽離子結合形成難溶性磷肥。鉀的利用率也只有50%左右。化肥大量使用使蔬菜瓜果品質**下降。由于作物不僅只需要氮磷鉀，同時還需要鈣鐵鋅硒等許多微量元素，而化肥一般成分比較單一，所以長期使用化肥必然導致土壤中所含養分趨于單一，易使作物營養失調，從而導致作物內部轉化合成受阻，必然導致作物品質下降，瓜不甜，菜不香。危害人體健康。大量施用化肥，易使蔬菜中硝酸鹽含量超標，而亞硝酸鹽與胺類物質結合形成N-亞硝酸基化合物為強致*物質。化肥的大量使用，還造成土壤的有益菌、蚯蚓的大量死亡。化肥的長期低效施用，往往造成土壤中某些元素的過分積累和土壤理化性質的變化及環境的污染。從中國大量使用化肥看，越使用化肥，地力就越下降，就越依賴化肥，由此形成惡性循環。具有提高作物產量、改善土壤質量、減少化肥使用、增強抗逆性和環保可持續等優勢。獼猴桃生物菌肥銷售廠
生物菌肥中的菌種能夠分解有機物質，改善土壤結構，增加通氣性和保水性，提高土壤肥力，減少土壤侵蝕。天津大豐收生物菌肥技術指導
生物菌肥對陽光中的紫外線十分敏感。存放或使用時盡量避免強光直接照射，因此生產上一般不采用地表撒施，可以在陰天或清晨、傍晚于土壤中施用。噴霧時只要在植物的葉片背面均勻噴布即可。混合使用：生物菌肥可以單獨施用，但是不能完全代替化肥或有機肥，事實是與后兩者混合使用的效果要好于它們的單獨使用。要謹慎不要將菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫的化肥(如硫酸鉀等)以及草木灰混合用，因為這些藥、肥，很容易殺死生物菌。或者先施菌肥，隔48小時后，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。還應防止與未腐熟的農家肥混合施用。施用時期：要注重生物菌肥不是***肥，一般做底肥，如果追施，在作物的營養臨界期和營養大量吸收期前一周施用，效果好。而在蔬菜等經濟作物上，微生物菌劑應采用蘸根、灌根的方式進行集中施用，微生物菌劑的施用量不能過大。因為生物菌肥施入土壤后有一個菌群繁殖、壯大的過程。因此，要先于作物需肥期10-15天施用，此后生物菌肥可以長期、均勻、持續地供給作物養分。天津大豐收生物菌肥技術指導
