T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因編輯中的應用主要體現在突變體檢測和基因編輯效率評估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具體應用步驟和特點:1.**基因編輯效率評估**:-T7EI用于評估CRISPR-Cas9在給定的導向RNA靶位點上對細胞群體進行基因編輯的效率。-通過PCR擴增圍繞CRISPR導向RNA靶位點的基因組DNA,如果CRISPR-Cas9介導的非同源末端連接(NHEJ)修復事件引入了突變,變性和退火將形成突變型和野生型PCR擴增子的異源雙鏈DNA。2.**突變體檢測**:-如果CRISPR/Cas9編輯成功在DNA上引入突變,則可與野生型DNA片段退火產生異質雙鏈DNA。T7EI可以識別該DNA上的不完全配對的DNA位點然后進行雙鏈切割,通過瓊脂糖凝膠電泳即可顯示酶切后的條帶,從而半定量判定基因編輯效果。-T7EI能識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導致的錯配DNA,不能識別1bp的插入、缺失或突變。3.**實驗步驟**:-收集細胞并提取基因組DNA,然后使用PCR擴增期望編輯的基因組區域。擴增子的長度建議為0.5-1kb。-對擴增的DNA進行變性和退火復性,以產生異質雙鏈DNA。-使用T7EI酶處理退火后的DNA產物,在37℃孵育15分鐘。
Cre重組酶在基因編輯中的操作主要涉及以下幾個步驟:1.**識別與結合**:-Cre重組酶首先識別并分別結合兩個LoxP序列的兩個反向重復序列,形成一個二聚體。2.**四聚體形成**:-兩個二聚體互相靠近,形成由四個Cre分子與兩個LoxP位點結合形成的四聚體復合物。3.**DNA切割與交換**:-Cre重組酶在每個LoxP位點的間隔序列中引導單鏈切割,產生帶有3’端羥基的斷裂。每個LoxP位點的兩個單鏈分別被切割。切割產生的自由3’端與對側的3’端進行交換和重連,形成Holliday交叉結構。4.**分子重組與解旋**:-Holliday交叉結構通過Cre酶的作用被解旋并重組,形成新的重組產物。這個過程導致兩個LoxP位點之間的DNA序列被刪除、反轉或易位,具體效果取決于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**條件性基因編輯**:-通過建立特異性Cre小鼠,該小鼠中的Cre重組酶由特定啟動子驅動,可在特定細胞或組織或全身表達Cre重組酶。與帶有Lox位點的Flox小鼠雜交,子代中可以獲得既帶有Cre又帶有Flox基因的小鼠,實現條件性基因打靶(表達或敲除靶基因)。Recombinant Human CYTL1/C17 Protein,hFc Tag來源于 Thermococcus kodakaraensis,具有高熱穩定性和校正能力,適用于長片段PCR和熱啟動PCR。
在PCR實驗中,確保引物與目標序列的完全特異性是至關重要的,這可以通過以下幾個步驟實現:1.**基于已知序列設計引物**:根據目標DNA序列,使用計算機軟件(如Primer3、Snapgene等)設計出兩個互補的引物,以保證引物的特異性和準確性。2.**引物長度和Tm值**:通常選擇引物長度為18-25個核苷酸,引物的Tm值(熔解溫度)通常選擇在50-60℃之間,以保證引物和目標DNA序列的穩定性。3.**避免與其他DNA序列的交叉反應**:使用BLAST等計算機軟件進行引物特異性檢查,確保引物只與目標序列互補,而不與其他非目標序列發生雜交。4.**避免引物自身結合**:設計引物時要避免引物之間自身結合,因為這會影響PCR反應的特異性和效率。5.**引物的3'端設計**:引物的3'端應避免富含GC,以確保與模板序列的穩定結合。同時,避免3'端存在序列,以防止形成引物二聚體。6.**避免內部二級結構**:設計引物時,應避免存在可能產生內部二級結構的序列,以保證引物與模板序列的結合。7.**使用在線工具進行引物特異性檢驗**:利用Primer-BLAST等在線工具設計引物,并進行特異性驗證,確保引物只擴增特定目標序列。
磁珠法病毒RNA/DNA抽提試劑盒是一種高效、便捷的工具,適用于從各種生物樣本中提取病毒核酸。以下是一些相關產品的信息和特點:1.**德諾優品病毒DNA/RNA提取試劑盒**:-采用自主磁珠純化技術,適合從血漿、血清等樣本中分離純化病毒的DNA或RNA。-操作簡單,整個過程可在12-25分鐘內完成,提取的核酸可直接用于下游應用,如PCR和NGS等。-提取的核酸純度高,質量穩定可靠,適合低拷貝數的病毒檢測。2.**MolPure®磁珠法病毒DNA/RNA提取試劑盒**:-適用于從全血、血清、腦脊液等樣本中提取病毒核酸。-無需使用有毒的酚氯仿,安全快捷,提取過程可在40分鐘內完成。-提取的產物可直接用于PCR、qPCR等實驗。3.**FineMag快速磁珠法病毒DNA/RNA提取試劑盒**:-適合從全血、唾液、拭子等樣本中純化高質量病毒核酸,提取過程只需13分鐘。-無需使用有毒的化學試劑,操作安全便捷。4.**MagMAX病毒RNA/DNA提取試劑盒**:-適用于從全血、血清、口腔液等樣本中提取病毒核酸。-該試劑盒支持高通量提取,適合自動化操作,提取效率高,適合直接用于PCR和RT-PCR。
蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MNase)是一種特殊的融合蛋白,它結合了蛋白A和微球菌核酸酶(MNase,MicrococcalNuclease)的特性。以下是pA-MNase的一些關鍵特點和應用:1.**融合表達產物**:pA-MNase是蛋白A與微球菌核酸酶MNase的融合表達產物,因此它同時具有ProteinA的抗體結合活性和MNase的核酸內切酶活性。2.**雙重功能**:由于其雙重功能,pA-MNase常用于蛋白質-DNA相互作用研究,特別是在ChIC(ChromatinImmunocleavage)和CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)技術中。3.**ProteinA的特性**:ProteinA是一種發現于金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的細胞壁表面蛋白,分子量為42kDa,能特異性地與哺乳動物免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)結合,通常結合部位為免疫球蛋白的Fc區。4.**微球菌核酸酶(MNase)的特性**:MNase是一種核酸內切酶,能夠降解核酸,常用于降解蛋白質制備中存在的核酸,減少細胞裂解液的粘度,以及用于染色質結構分析和快速RNA測序。5.**反應條件**:MNase的反應條件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer,需要補充100μg/ml重組白蛋白,分子生物學級,并在37°C下孵化。來源于Francisella tularensis:FnCas12a是一種來源于Francisella tularensis菌株的核酸內切酶。Recombinant Canine MCP-2/CCL8
T4 DNA 聚合酶是一種模板依賴的 DNA 聚合酶,需要特定的 DNA 模板才能進行 DNA 合成反應。Recombinant Human ENA-78,5-78 aa/CXCL5
牛痘DNA拓撲異構酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實驗室中的使用主要涉及以下幾個步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓撲異構酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價連接形成穩定復合物,遇到DNA的5’-OH基團后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫中,牛痘DNA拓撲異構酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實現DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質粒解旋**:將超螺旋質粒DNA與牛痘DNA拓撲異構酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實現質粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓撲異構酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實現接頭的連接。4.**注意事項**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長的尾巴會導致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應用廣,在不同的實驗中使用策略不同,需要靈活運用,并根據具體文獻進行調整。
Recombinant Human ENA-78,5-78 aa/CXCL5
Probe qPCR Mix (2×, UDG Plus):高效防污染的探針法qPCR解決方案Probe qPCR Mix (2×, UDG Plus) 是一種為探針法實時熒光定量PCR(qPCR)設計的即用型預混液,結合了熱啟動Taq DNA聚合酶、優化的反應緩沖液、dUTP和UDG酶,能夠有效防止PCR產物污染,提高檢測的特異性和準確性。產品特點高特異性和靈敏度:采用抗體修飾的熱啟動Taq DNA聚合酶,結合優化的反應緩沖液,有效減少非特異性擴增,提高檢測靈敏度。防污染設計:預混液中包含UDG酶和dUTP,可在反應前降解含尿嘧啶的PCR產物,防止氣溶膠污染。多重檢測能力:支持多重qPCR反...